[发明专利]一种生物基因序列的概要数据生成方法及系统有效
| 申请号： | 202110551818.2 | 申请日： | 2021-05-20 |
| 公开（公告）号： | CN113496762B | 公开（公告）日： | 2022-09-27 |
| 发明（设计）人： | 刘卫国;林浩然;徐晓明;殷泽坤 | 申请（专利权）人： | 山东大学 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;G16B50/00 |
| 代理公司： | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人： | 祖之强 |
| 地址： | 250014 山*** | 国省代码： | 山东;37 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本公开提供了一种生物基因序列的概要数据生成方法及系统，获取待处理的基因序列；将待处理的基因序列利用滑动窗口进行K‑mer分解，将M个K‑mer及其对应的M个反向互补链的K‑mer进行对比，对每对正向、反向K‑mer，选取字符值较小的K‑mer，最终得到M个K‑mer，然后进行向量化转置操作；将转置操作得到的向量输入到基于单指令多数据流SIMD改进的哈希函数中，得到各个向量对应的哈希值；继续滑动窗口获取新的子序列K‑mer，重复上述操作，直到待处理基因序列的所有K‑mer都计算出对应的哈希值，根据所有的哈希值构建待处理基因序列的哈希值列表；根据哈希值列表，生成待处理的基因序列的概要数据；本公开采用向量化的实现方式，计算速度更快，能够实现生物基因序列的更高效处理。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 生物 基因 序列 概要 数据 生成 方法 系统 | ||
【主权项】：
暂无信息
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于山东大学，未经山东大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/202110551818.2/，转载请声明来源钻瓜专利网。
