[发明专利]一种基于三代测序的病原微生物宏基因组检测方法有效
申请号: | 202110567044.2 | 申请日: | 2021-05-24 |
公开(公告)号: | CN113160882B | 公开(公告)日: | 2022-11-15 |
发明(设计)人: | 邹珂珂;赵科研;马欣;刘菲;李珊 | 申请(专利权)人: | 成都博欣医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G16B30/10;G16B50/00 |
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地址: | 610000 四川省*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于三代测序的病原微生物宏基因组检测方法,包括获取样本三代测序的原始基因检测数据,去除干扰序列,保留非人源数据;建立全物种核酸数据库与全物种分类数据库的映射关系;去除映射关系集合中的无效映射关系,得到非人源数据和全物种分类数据库的有效映射关系集合,并根据有效映射关系集合计算得到物种鉴定结果;构建微生物注释数据库,获得微生物注释信息;构建微生物耐药数据库,获得微生物耐药信息;根据物种鉴定结果、微生物注释信息和微生物耐药信息,获得微生物检测报告。本发明通过建立非人源数据,优化映射结果,提高检测精度,提高了相似区域物种分类的准确性,进而经过预测比对序列结果得到物种。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 三代测序 病原微生物 宏基 检测 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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