[发明专利]基于液体活检的ctDNA突变程度分析方法和装置、ctDNA性能分析装置有效

专利信息
申请号: 202110650420.4 申请日: 2021-06-10
公开(公告)号: CN113257350B 公开(公告)日: 2021-10-08
发明(设计)人: 李庆原;谢泓禹;刘异倩;刘小莉;洪媛媛;王小庆;韩天澄;杨顺莉;于佳宁;陈维之;何骥;杜波 申请(专利权)人: 臻和(北京)生物科技有限公司;臻和精准医学检验实验室无锡有限公司;无锡臻和生物科技股份有限公司
主分类号: G16B20/50 分类号: G16B20/50;G16B50/30;G16B40/00
代理公司: 常州佰业腾飞专利代理事务所(普通合伙) 32231 代理人: 陈红桥
地址: 100191 北京市海*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种基于液体活检的ctDNA突变程度分析方法和装置、ctDNA性能分析装置,其中,突变程度分析方法包括:对待检测血浆样本进行捕获测序得到FASTQ文件;分别提取配对reads中的分子标签并存储为uBAM文件;将FASTQ文件的基因序列与参考基因组进行比对并去重,并将其与uBAM文件合并得到含有分子标签的BAM文件;对BAM文件中的reads进行聚集并去重;在基因突变panel区域得到样本原始突变集合,并对其中的基因突变参数进行统计;对样本原始突变集合进行过滤,对各样本的基因突变参数进行统计;针对样本的基因突变参数对待检测血浆样本的突变程度进行评估,提高ctDNA突变检测的灵敏度。
搜索关键词: 基于 液体 活检 ctdna 突变 程度 分析 方法 装置 性能
【主权项】:
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