[发明专利]参考蛋白质数据库的构建方法、存储介质、电子设备在审
申请号: | 202110662956.8 | 申请日: | 2021-06-15 |
公开(公告)号: | CN113393903A | 公开(公告)日: | 2021-09-14 |
发明(设计)人: | 戚良 | 申请(专利权)人: | 上海君谊生物科技有限公司 |
主分类号: | G16B50/00 | 分类号: | G16B50/00;G16B20/20;G16B20/50 |
代理公司: | 上海隆天律师事务所 31282 | 代理人: | 钟宗 |
地址: | 200072 上海市静*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明属于生物技术领域,特别涉及一种参考蛋白质数据库的构建方法,包括如步骤:S2、获取公共数据库中的SNP位点信息,对SNP位点进行筛选,得到导致编码氨基酸改变的SNP位点列表;S3、在SNP位点列表中根据样品的蛋白丰度筛选出表达量高的蛋白质的SNP位点;S4、生成筛选后的SNP位点列表对应的可遗传变异肽,将所述可遗传变异肽加入公共蛋白质数据库的参考蛋白质序列,以生成基于样品的参考蛋白质数据库,所述参考蛋白数据库包含所述可遗传变异肽。本发明的参考蛋白质数据库基于样品,从而避免错误去除蛋白质而产生的误差,提高有效数据完整性,也不会导致纳入过多的遗传变异信息造成高度冗余性。 | ||
搜索关键词: | 参考 蛋白质 数据库 构建 方法 存储 介质 电子设备 | ||
【主权项】:
暂无信息
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