[发明专利]一种微生物宏基因组分箱方法及系统有效
申请号: | 202110693173.6 | 申请日: | 2021-06-22 |
公开(公告)号: | CN113205856B | 公开(公告)日: | 2022-07-12 |
发明(设计)人: | 刘健;田妹;陈娇 | 申请(专利权)人: | 南开大学 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 闫圣娟 |
地址: | 300071 天津*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | 本公开提供了一种微生物宏基因组分箱方法及系统,包括:获取待分箱的微生物宏基因组序列;对所述宏基因组序列中每条序列进行特征提取,将提取的特征输入VAE‑GAN神经网络中进行训练,通过训练将提取的特征编码到VAE隐含向量中;基于所述VAE隐含向量中的均值变量,对所述宏基因组序列进行聚类,实现宏基因组的分箱;相对于现有方法,本公开所述方案采用了多种特征融合的方式,对宏基因组的序列特征进行深度挖掘,实现了对宏基因组序列的精确描述,同时,为了提高算法的处理效率,利用VAE‑GAN神经网络对所提取的特征进行特征降维,所述降维方法在降低特征维度的同时,充分保留了序列特征中的必要成分,良好的平衡了分箱精度与分箱时间的关系。 | ||
搜索关键词: | 一种 微生物 宏基 组分 方法 系统 | ||
【主权项】:
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