[发明专利]基于质谱分析数据的GBS菌株的克隆复合体分型系统及应用在审
申请号: | 202110710482.X | 申请日: | 2021-06-25 |
公开(公告)号: | CN113313257A | 公开(公告)日: | 2021-08-27 |
发明(设计)人: | 刘海英;黄莲芬;高坎坎;钟华敏;邓秋连;谢永强;李姿娴;陈光炼 | 申请(专利权)人: | 广州市妇女儿童医疗中心 |
主分类号: | G06N3/12 | 分类号: | G06N3/12;G06K9/62;G01N27/62;G01N30/02;G01N30/72;G01N33/68 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 宋南 |
地址: | 510000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了基于质谱分析数据的GBS菌株的克隆复合体分型系统及应用。所述分型系统包括:数据收集模块,用于获取GBS菌株蛋白质样本质谱数据;分型模块,用于对质谱数据进行分型处理;所述的分型处理采用基于遗传算法、SVM、KNN、RF、XGB等分类算法或聚类分析方法构建的GBS菌株克隆复合体的识别模型。该系统通过遗传算法等分类算法或聚类分析方法构建GBS菌株常见克隆复合体的自动识别模型,与现有耗时长、操作繁琐、费用昂贵的分子生物学GBS菌株分型方法相比,能够在菌种鉴定的同时,不需花费其他成本且快速分型,尤其是甄别高致病型CC17亚群,具有快速、准确、低成本、高通量,更高的灵敏度和准确率。 | ||
搜索关键词: | 基于 谱分析 数据 gbs 菌株 克隆 复合体 系统 应用 | ||
【主权项】:
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