[发明专利]基于家系的低深度测序检测染色体单亲二体的方法在审

专利信息
申请号: 202110726077.7 申请日: 2021-06-29
公开(公告)号: CN113593644A 公开(公告)日: 2021-11-02
发明(设计)人: 陈样宜;黄楷胜;刘燕霞;刘远如;焦伟刚 申请(专利权)人: 广东博奥医学检验所有限公司
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10
代理公司: 东莞众业知识产权代理事务所(普通合伙) 44371 代理人: 何恒韬
地址: 523000 广东省东莞*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明通过利用胎儿与父母的样本之间各染色体均大量存在cdSNPs的特点,公开了一种基于家系的低深度测序检测染色体单亲二体的方法,包括如下步骤:S1、序列比对,家系CNV‑seq的三个原始数据文件通过比对后得到三个有比对信息的文件;S2、序列过滤;S3、选择人群高频杂合的SNP位点数据集;S4、获取cdSNP位点列表;S5、统计母子、父子的样本间总体CR值和各染色体的CR值;S6、根据CR值进行胎儿的染色体UPD分析,得出结论。本发明无需改变CNV‑seq检测流程和检测成本,仅需利用家系的CNV‑seq原始数据文件进行分析比较,即可鉴定胎儿的染色体是否存在UPD,具有检测成本低,检测准确度高的优点。
搜索关键词: 基于 家系 深度 检测 染色体 单亲 方法
【主权项】:
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