[发明专利]一种基于异构图卷积神经网络的合成致死相互作用预测方法在审
| 申请号： | 202110793581.9 | 申请日： | 2021-07-08 |
| 公开（公告）号： | CN113436729A | 公开（公告）日： | 2021-09-24 |
| 发明（设计）人： | 卢新国;陈关元;李金鑫;袁玥;陈湘涛 | 申请（专利权）人： | 湖南大学 |
| 主分类号： | G16H50/20 | 分类号： | G16H50/20;G16H50/70;G06N3/04;G06N3/08;G16B20/00 |
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| 地址： | 410082 湖南省*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | 本发明涉及生物信息学中的数据挖掘领域，具体涉及一种基于异构图卷积神经网络的合成致死相互作用预测方法。其发明内容主要包括：(1)收集已知合成致死相互关联数据、基因GO信息数据、基因PPI数据；(2)进行基因GO相似性分析，利用基于语义基因功能相似性度量算法对基因与基因之间的GO功能相似性进行度量，构建基因基于GO功能相似性的特征；(3)进行基因基于PPI特征的构建，利用蛋白质相互关联数据构建蛋白质和蛋白质之间的关联网络，通过随机游走的方式获取每一个基因基于蛋白质相互关联网络的特征；(4)利用合成致死相互关联数据构建邻接矩阵，融合基因基于GO功能相似性特征和基于PPI特征的领域特征；(5)构建基于图卷积神经网络的合成致死对预测模型，预测潜在的合成致死相互作用，得到最终结果。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 构图 卷积 神经网络 合成 致死 相互作用 预测 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
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