[发明专利]一种基于多角度编码和特征选择的DNA结合蛋白识别方法在审

专利信息
申请号: 202110815562.1 申请日: 2021-07-19
公开(公告)号: CN113555064A 公开(公告)日: 2021-10-26
发明(设计)人: 宋晓宁;周李玲;冯振华 申请(专利权)人: 江南大学
主分类号: G16B40/20 分类号: G16B40/20;G16B50/30;G16B30/10;G16B25/00;G06K9/62
代理公司: 南京禹为知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32272 代理人: 王晓东
地址: 214122 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种基于多角度编码和特征选择的DNA结合蛋白识别方法,包括,在训练阶段,iDBP‑DEP利用四种表示方法对蛋白质序列进行编码,得到3240维的特征向量作为初始特征;根据特征选择算法选择最优的特征子集;所述iDBP‑DEP将所述子集输入SVM分类器进行训练,得到预测模型;测试集中的每个蛋白质通过相同的步骤进行编码,得到对应的最佳特征子集,并输入所述预测模型中进行预测,最终获得相应的预测结果。本发明方法提供的iDBP‑DEP在各项评估指标上均展现了优越的性能,具有较良好的有效性和稳定性。
搜索关键词: 一种 基于 角度 编码 特征 选择 dna 结合 蛋白 识别 方法
【主权项】:
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