[发明专利]一种基于多个基因组比较和二代测序数据的全基因组关联分析方法有效
申请号: | 202110849440.4 | 申请日: | 2021-07-27 |
公开(公告)号: | CN113628685B | 公开(公告)日: | 2022-03-15 |
发明(设计)人: | 王健;赵均良;杨武;李方平;刘斌;董景芳 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院水稻研究所 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B20/20;G16B50/10 |
代理公司: | 湖南楚墨知识产权代理有限公司 43268 | 代理人: | 杜承功 |
地址: | 510640 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于多个基因组比较和二代测序数据的全基因组关联分析方法,步骤一:使用比对软件将参考基因组和从头组装基因组文件进行比对,步骤二:根据插入片段大小及插入到参考基因组的位置,更新参考基因组中的注释基因位置或结构,步骤三:如果有多个从头组装基因组,依次迭代更新参考基因组;步骤四:利用比对软件将样品的二代测序数据比对到更新后的参考基因组上,步骤五,收集所有样品全部结构变异的分界点位置信息至一个集合中,构建群体基因型,步骤六:根据关联位点和更新后的参考基因组注释文件进行功能基因的候选,本发明实现了利用结构变异基因型数据进行全基因组关联分析。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 基因组 比较 二代 序数 关联 分析 方法 | ||
【主权项】:
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