[发明专利]CYP21A2基因NGS数据分析的方法、装置及应用在审

专利信息
申请号: 202111057946.8 申请日: 2021-09-09
公开(公告)号: CN113724791A 公开(公告)日: 2021-11-30
发明(设计)人: 刘风侠;孙隽;周梅珍;许莹硕;樊春娜;王垚燊;彭智宇 申请(专利权)人: 天津华大医学检验所有限公司;华大生物科技(武汉)有限公司
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10;G16B20/50;G16B20/30;G16B20/20
代理公司: 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 代理人: 李小焦;彭家恩
地址: 300000 天津市天津自贸区(空港经*** 国省代码: 天津;12
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摘要: 本申请公开了一种CYP21A2基因NGS数据分析的方法、装置及应用。本申请方法包括,对芯片捕获区域设定窗口和滑动窗口,根据每个窗口深度及GC含量进行深度修正,对修正后的深度,根据隐马模型计算各窗口拷贝数;统计CYP21A2基因区域序列,挑选成对序列,根据成对序列区间内目标位点和辅助位点位置,判定目标位点和辅助位点的碱基,对照参考序列目标位点真假基因处碱基,判定该成对序列支持真基因突变或未突变;利用待测样本拷贝数校正的值,对照每个位点设定阈值,确定小于阈值的样本为突变候选样本;综合以上结果,添加各样本突变位点数提示CNV,获得CYP21A2基因的CNV和点突变结果。本申请方法,利用高通量测序数据能准确有效的获得CYP21A2基因的拷贝数变异和点突变信息。
搜索关键词: cyp21a2 基因 ngs 数据 分析 方法 装置 应用
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