[发明专利]修补基因组序列组装缺口的方法和装置有效
| 申请号： | 202111251612.4 | 申请日： | 2021-10-27 |
| 公开（公告）号： | CN113782099B | 公开（公告）日： | 2022-03-04 |
| 发明（设计）人： | 周勋;王龙;田仕林;赵勇;周智伟;陶琳娜 | 申请（专利权）人： | 北京诺禾致源科技股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B30/20;G16B40/00 |
| 代理公司： | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人： | 路秀丽 |
| 地址： | 102200 北京市昌平区*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种修补基因组序列组装缺口的方法和装置。其中该方法包括：利用参考基因组序列信息与待修补基因组序列进行比对，获得组装缺口的第一版待替换序列信息；利用三代测序原始数据对第一版待替换序列信息进行二次检验和修正，并填补组装缺口，得到第一版修补后基因组序列；将第一版修补后基因组序列重新作为待修补基因组序列进行重复迭代，直至组装评估结果满足完整性要求，停止迭代；将停止迭代时对应的版本的修补后基因组序列作为终版修补缺口后的基因组序列；每次迭代所用的参考基因组序列信息为来源于同物种不同个体的参考基因组序列。该方法在需要计算的数据量、修复组装的完整性、计算的效率和结果展示方面均有较大提升。 | ||
| 搜索关键词： | 修补 基因组 序列 组装 缺口 方法 装置 | ||
【主权项】：
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