[发明专利]提升基因组组装完整性的方法、装置及其应用有效

专利信息
申请号: 202111365725.7 申请日: 2021-11-18
公开(公告)号: CN113808668B 公开(公告)日: 2022-02-18
发明(设计)人: 李本萍;田仕林;周勋;陶琳娜;王静 申请(专利权)人: 北京诺禾致源科技股份有限公司
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10;G16B30/20;G16B40/00
代理公司: 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 代理人: 路秀丽
地址: 102200 北京市昌平区*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种提升基因组组装完整性的方法、装置及其应用。该方法包括:获取目标样本的初步的染色体版本基因组;利用三代测序短序列与初步的染色体版本基因组的序列进行比对,将最优比对短序列根据染色体进行聚类,得到多个类群;在多个类群里对三代测序短序列的序列进行局部组装,从而获得完整性提升的组装基因组序列。通过首先利用测序序列,进行常规组装得到初组装基因组序列并进行染色体挂载之后,将三代短序列比对回上述的基因组上,将最优比对的三代短序列根据染色体聚成多个类群,之后在每个类群里做三代局部组装,从而获得完整性更高的基因组序列。
搜索关键词: 提升 基因组 组装 完整性 方法 装置 及其 应用
【主权项】:
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