[发明专利]一种基于深度学习连接片段的化合物优化方法在审

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申请号: 202111408686.4 申请日: 2021-11-24
公开(公告)号: CN114187978A 公开(公告)日: 2022-03-15
发明(设计)人: 杨跃东;戴凌雪;谭游海;王一 申请(专利权)人: 中山大学
主分类号: G16C20/50 分类号: G16C20/50;G16C20/70;G16C20/90;G06N3/04;G06N3/08;G06N20/20;G06N5/00
代理公司: 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 代理人: 禹小明
地址: 510275 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了一种基于深度学习连接片段的化合物优化方法,包括步骤如下:S1:基于药物发现数据库对Transformer模型进行预训练,将Transformer模型初始化Prior先验模型和Agent模型;S2:随机选择一对片段作为源序列输入;S3:Agent模型通过采样方式批量生成新分子;S4:将生成的新分子输入奖励模块得到每个新分子的奖励值,判断新分子的奖励值是否达到预期,若没有达到预期,则执行S5;若达到预期,则执行S6;S5:将源序列及Agent模型生成的新分子送入Prior先验模型进行监督训练得到新分子的先验似然,将先验似然与S4得到的奖励值组成增强似然;根据新分子的重复性得到一个惩罚矩阵,根据增强似然、惩罚矩阵更新Agent模型的网络参数,并回到步骤S3;S6:完成对Agent模型的网络参数的调整。
搜索关键词: 一种 基于 深度 学习 连接 片段 化合物 优化 方法
【主权项】:
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