[发明专利]基因组的组装方法及装置、计算机可读存储介质、处理器在审

专利信息
申请号: 202111417602.3 申请日: 2021-11-25
公开(公告)号: CN113918355A 公开(公告)日: 2022-01-11
发明(设计)人: 赵勇;周勋;田仕林;王龙;陶琳娜 申请(专利权)人: 天津诺禾致源生物信息科技有限公司
主分类号: G06F9/52 分类号: G06F9/52;G06F16/176;G16B50/30;G16B30/20
代理公司: 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 代理人: 张岳峰
地址: 301700 天津市*** 国省代码: 天津;12
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摘要: 发明公开了一种基因组的组装方法及装置、计算机可读存储介质、处理器。其中,该方法包括:响应于第一命令,以利用原始测序数据生成预定数据库;响应于第二命令,基于多个文件生成多个区块;响应于第三命令,获取多个区块内的目标数据,以基于目标数据得到目标文件;响应于第四命令,生成独占锁;在确定当前存在正在运行的文件时,锁定其他文件,以对正在运行的文件进行处理;在确定正在运行文件处理结束时,释放独占锁,以基于目标文件对原始测序数据进行处理,得到目标基因组。本发明解决了相关技术中对基因组组装时,由于受到计算机集群带宽和硬盘的速度限制,使得组装效率比较低的技术问题。
搜索关键词: 基因组 组装 方法 装置 计算机 可读 存储 介质 处理器
【主权项】:
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