[发明专利]基于图神经网络的miRNA-疾病关联预测在审

专利信息
申请号: 202111557995.8 申请日: 2021-12-20
公开(公告)号: CN114242237A 公开(公告)日: 2022-03-25
发明(设计)人: 庞善臣;庄雨 申请(专利权)人: 中国石油大学(华东)
主分类号: G16H50/20 分类号: G16H50/20;G16B40/00;G16B45/00;G06V10/44;G06V10/74;G06V10/80;G06V10/82;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 266580 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明提供了基于图神经网络的miRNA‑疾病关联预测。由于传统的神经网络模型无法处理miRNA‑疾病关联预测领域的不规则的非欧式空间数据。因此我们选用GraphSAGE模型对图节点进行特征提取。首先我们将整合的疾病相似度、整合的miRNA相似度映射到相同的特征空间,并利用已知的关联数据构建miRNA‑疾病二部图作为GraphSAGE的输入。通过GraphSAGE模型聚合邻居节点的信息,丰富节点特征表示,为下游预测任务提供有效的数据。最后将学习到的miRNA和疾病的潜在特征加权拼接后作为深度神经网络预测模型的输入,获得关联得分。利用交叉熵损失函数反向传播训练模型参数。
搜索关键词: 基于 神经网络 mirna 疾病 关联 预测
【主权项】:
暂无信息
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