[发明专利]基于条件随机场的微生物-疾病关联性预测方法及系统在审

专利信息
申请号: 202111563953.5 申请日: 2021-12-20
公开(公告)号: CN114496275A 公开(公告)日: 2022-05-13
发明(设计)人: 王红;滑美芳;王正军;杨雪;杨杰;张双永;张子姗;郑子希;李维新 申请(专利权)人: 山东师范大学
主分类号: G16H50/70 分类号: G16H50/70;G06K9/62;G06N3/04
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 闫伟姣
地址: 250014 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明公开了一种基于条件随机场的图卷积网络预测微生物‑疾病关联方法,所述方法包括:获取微生物和疾病的对应关系数据,构建微生物‑疾病关联矩阵;根据所述微生物‑疾病关联矩阵,获取微生物之间和疾病之间的相似性矩阵,与微生物‑疾病关联矩阵整合得到邻接矩阵;对所述微生物之间和疾病之间的相似性矩阵分别进行特征提取,组合得到特征矩阵;基于图卷积网络,根据所述邻接矩阵和特征矩阵,生成嵌入向量;根据条件随机场对嵌入向量进行更新;根据更新后的嵌入向量对关联矩阵进行重构。本发明通过图卷积网络,充分挖掘了微生物和疾病的特征,通过引入CRF层,保证了相似的微生物或疾病在特征空间也具有相似的嵌入,提高了关联预测的准确性。
搜索关键词: 基于 条件 随机 微生物 疾病 关联性 预测 方法 系统
【主权项】:
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