[发明专利]染色体水平基因组的组装方法和组装装置有效
申请号: | 202111649960.7 | 申请日: | 2021-12-29 |
公开(公告)号: | CN114464260B | 公开(公告)日: | 2023-09-26 |
发明(设计)人: | 赵勇;周勋;康玲;陶琳娜;王静 | 申请(专利权)人: | 上海诺禾致源医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | G16B30/20 | 分类号: | G16B30/20;G16B30/10 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 路秀丽 |
地址: | 201100 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明提供了一种染色体水平基因组的组装方法和组装装置。该组装方法包括:获取同一物种已知的染色体水平基因组作为参考基因组;将待组装个体的重叠群或支架通过与参考基因组比对,得到对应的坐标信息;根据坐标信息将待组装个体的重叠群或支架挂载到染色体水平,得到待组装个体的染色体水平的基因组。对于难以提供Hi‑C数据的物种,通过使用同一物种已发表的染色体水平基因组作为参考基因组,将新测个体的重叠群或支支架水平基因组比对到参考基因组,从而实现将新测个体有参挂载到染色体水平的目的。 | ||
搜索关键词: | 染色体 水平 基因组 组装 方法 装置 | ||
【主权项】:
暂无信息
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