[发明专利]基于连通图和生成式对抗网络的数据批次效应矫正方法在审

专利信息
申请号: 202210048433.9 申请日: 2022-01-17
公开(公告)号: CN114400047A 公开(公告)日: 2022-04-26
发明(设计)人: 王珣;张超岗;宋弢;王璐璐;孙玉雪 申请(专利权)人: 中国石油大学(华东)
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 266580 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明提供一种基于连通图和生成式对抗网络的数据批次效应矫正方法,包括如下步骤:1)数据预处理2)构建跨批次相似细胞连通图3)使用生成式对抗网络矫正批次效应。本发明属于生物信息分析技术领域,本发明提供的基于连通图和生成式对抗网络的数据批次效应矫正方法,为两批次、多批次、非重叠和小样本单细胞RNA‑seq数据集存在的批次效应提供了解决方案,它以来自不同批次的基因表达谱矩阵作为输入,并输出矫正后的基因表达谱,经过矫正后的基因表达可以结合每个批次的特征,并按照设定的模式调整每个批次的基因表达,这为研究不同批次细胞基因表达差异提供了新的见解。
搜索关键词: 基于 连通 生成 对抗 网络 数据 批次 效应 矫正 方法
【主权项】:
暂无信息
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