[发明专利]一种基于评分器和动态图网络的分子对接方法在审
申请号: | 202210226317.1 | 申请日: | 2022-03-09 |
公开(公告)号: | CN114758725A | 公开(公告)日: | 2022-07-15 |
发明(设计)人: | 邓岳;郭弢 | 申请(专利权)人: | 北京航空航天大学 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B15/30;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 姜海荣;肖莎 |
地址: | 100191*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于评分器和动态图网络的分子对接方法,包括以下步骤:构建预测器的图神经网络,即定义节点特征及边特征;对上述构建的预测器的图神经网络进行更新;基于预测器对亲和力进行预测;构建及训练预测器的损失函数;构建生成器,对数似然函数进行定义;基于生成器对数似然函数的梯度进行预测;对生成器进行训练,基于朗之万采样进行构象优化;基于预测器及生成器,完成分子对接。利用图神经网络实现小分子与蛋白质的对接,利用动态构建图神经网络进行蛋白质和小分子的表征学习,利用图神经网络训练好一个判别器,能够捕获蛋白质和小分子的相互作用,并对亲和力进行预测,有利于发现亲和力更高的对接构象。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 评分 动态 网络 分子 对接 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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