[发明专利]一种基于网络最大信息流模型的生物标记物识别系统在审

专利信息
申请号: 202210227861.8 申请日: 2022-03-08
公开(公告)号: CN114582418A 公开(公告)日: 2022-06-03
发明(设计)人: 刘治平;高子玉;杨佳新;高瑞 申请(专利权)人: 山东大学
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B25/10
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 黄海丽
地址: 250061 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明属于生物信息处理技术领域,提供了一种基于网络最大信息流模型的生物标记物识别系统,包括:获取与预设疾病相关的基因表达数据,并构建蛋白质相互作用网络;对所述基因表达数据进行处理,得到靶基因和差异表达基因;基于蛋白质相互作用网络构建特异性蛋白质相互作用网络,选取靶基因到差异表达基因之间的最短通路,并构建关于靶基因的子网络;基于靶基因的子网络建模为电阻网络,利用基尔霍夫电流定律计算每个电阻网络中各节点的信息流分数;比较相同节点在不同电阻网络中的信息流分数,仅保留信息流得分最大的节点在原网络中,最终得到合格模块;对所得合格模块进行逻辑斯蒂模型拟合,得到假设含有某模块而患病的可能性。
搜索关键词: 一种 基于 网络 最大 信息 模型 生物 标记 识别 系统
【主权项】:
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