[发明专利]单细胞转录组数据伪时间轨迹的分析方法及计算机系统

摘要

本发明公开了一种单细胞转录组数据伪时间轨迹的分析方法及计算机系统，其包括：1)计算基因显式比较优势矩阵；2)利用相似度得到基因相识度矩阵，构建基因网络；3)在基因网络中取初始节点，并从初始节点开始随机行走，记录走过的每一个基因，形成由基因序列构成的基因文本；4)将基因文本转换成基因的词向量；5)将单细胞表达的基因矢量以表达量为权重加和，形成的和矢量作为该单细胞在基因空间中的词向量表示；6)将所有的细胞的矢量表示进行可视化处理，得到胚胎细胞发育伪时间轨迹结果。本发明为鉴别组织中不同的稀有细胞亚型和不同细胞亚型的变异基因提供分析基础，在肿瘤、发育生物学、生命科学等领域有广泛重要的应用前景。