[发明专利]一种基于16SrRNA扩增子测序检测土壤致病细菌生物污染的方法在审
| 申请号： | 202210309960.0 | 申请日： | 2022-03-28 |
| 公开（公告）号： | CN114703265A | 公开（公告）日： | 2022-07-05 |
| 发明（设计）人： | 江高飞;韦中;杨欣润;徐阳春;沈其荣 | 申请（专利权）人： | 南京农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/689;G16B30/00;G16B50/00 |
| 代理公司： | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人： | 许轲;徐冬涛 |
| 地址： | 210095 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于16SrRNA扩增子测序检测土壤致病细菌生物污染的方法，其包括步骤为：步骤一、构建土壤非冗余致病细菌数据库；步骤二、完成对土壤/植物样品DNA的提取；步骤三、完成样品的16S rRNA基因测序，获得测序下机数据；步骤四、采用DADA2分析流程封装土壤非冗余致病细菌库，获得代表性序列；步骤五、将代表性序列与土壤非冗余致病菌数据库比对注释致病细菌，得到最终的ASV物种表，通过R语言对ASV物种表中不同样品的致病细菌组成、多样性特征等进行可视化作图。本发明能快速、精准检测致病菌，且不易受到样品污染的影响，可而可实现快速、全面、准确检测致病菌的目标。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 16 srrna 扩增 子测序 检测 土壤 致病 细菌 生物 污染 方法 | ||
【主权项】：
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