[发明专利]适用复杂性状的基因-环境交互的分析方法及存储介质有效
申请号: | 202210373636.5 | 申请日: | 2022-04-11 |
公开(公告)号: | CN114898809B | 公开(公告)日: | 2022-12-23 |
发明(设计)人: | 张纪峰;毕文健;马雨茁;赵延龙 | 申请(专利权)人: | 中国科学院数学与系统科学研究院 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B20/20 |
代理公司: | 合肥天明专利事务所(普通合伙) 34115 | 代理人: | 苗娟 |
地址: | 100190 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了一种适用复杂性状的基因‑环境交互的分析方法及存储介质,方法包括:获取表型数据、基因型数据、环境因素数据和混杂因素数据;选择分析所需的广义线性回归模型,在边际遗传效应与边际基因‑环境交互作用均为0的假设下拟合约束模型、估计模型参数并计算残差;对于待检验的位点,估计其次要等位基因频率,基于score统计量检验其边际遗传效应的显著性;选择并计算相应的用于检验边际基因‑环境交互作用显著性的检验统计量;使用正态分布近似方法与鞍点近似方法相结合的混合检验策略计算统计p值以检验边际基因‑环境交互作用的显著性,实现全基因组范围的关联分析。本发明具有适用范围广、分析速度快、准确度高等优点。 | ||
搜索关键词: | 适用 复杂 性状 基因 环境 交互 分析 方法 存储 介质 | ||
【主权项】:
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