[发明专利]一种基因组变异检测方法及检测系统有效
申请号: | 202210391526.1 | 申请日: | 2022-04-14 |
公开(公告)号: | CN114999573B | 公开(公告)日: | 2023-07-07 |
发明(设计)人: | 刘珍;姜玥 | 申请(专利权)人: | 哈尔滨因极科技有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B40/00;G16B20/30;G16B20/20;G06F18/2411;G06F18/214 |
代理公司: | 重庆百润洪知识产权代理有限公司 50219 | 代理人: | 刘子钰 |
地址: | 150000 黑龙江省哈尔滨*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | 本发明提出了一种基因组变异检测方法和检测系统,将样本的基因组划分成连续非重叠窗口,将每个窗口参考序列分别和测序序列进行序列比对,并进行Reads深度信息的标准化处理,根据所述序列比对结果以及深度信息,确定所述基因组的潜在变异区域;应用De‑Bruijn图和哈希表,将测序序列与参考序列进行匹配,得到最佳单倍体;根据中间比对结果与最终比对结果之间的映射关系,获得每个测序序列与参考序列的校正对齐结果;根据每个测序序列与所述参考序列的校正对齐结果,确定断点;对断点进行筛选,确定拷贝数变异区域,利用深度信息计算拷贝数变异区域内的拷贝数变异比例,得到准确的拷贝数变异检测结果。 | ||
搜索关键词: | 一种 基因组 变异 检测 方法 系统 | ||
【主权项】:
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