[发明专利]一种对多物种进行多核苷酸变异鉴定和注释的方法有效
申请号: | 202210435556.8 | 申请日: | 2022-04-24 |
公开(公告)号: | CN114724628B | 公开(公告)日: | 2022-11-08 |
发明(设计)人: | 龚静;金炜炜;蒋政;曹文 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20;G16B50/30;G16B50/10 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 | 代理人: | 李鹏 |
地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明公开了一种对多物种进行多核苷酸变异鉴定和注释的方法,根据已经定向好的数据集VCF,获得所有双点MNV为数据集TwoPointMNV;将数据集TwoPointMNV中所有鉴定到的双点MNV拆成单点为数据集SNV,并根据数据集SNV从数据集VCF中获取单点的行信息作为数据集SNVInfoVCF;鉴定7位点至2位点MNV,获得鉴定后的MNV并进行基于基因注释、基于非编码区注释和基于调控区注释。本发明支持大于双点的MNV的鉴定,不仅增加鉴定到的MNV的数量,而且也过滤掉原先被错误鉴定的MNV,有效对MNV进行注释。 | ||
搜索关键词: | 一种 物种 进行 多核苷酸 变异 鉴定 注释 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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