[发明专利]一种基于堆叠式集成策略的用于高效识别特定细胞系增强子-启动子相互作用的预测方法

摘要

本发明公开了一种涉及生物信息领域的基于堆叠式集成策略用于高效识别特定细胞系增强子‑启动子相互作用的预测方法。该预测方法的步骤为：获取6个特定的人类细胞系中的增强子、启动子基因序列，对所有的细胞系的非平衡序列数据进行相同的数据预处理；使用6种特征提取方式提取特征；使用7种计算方法以堆叠式集成的方式训练模型。输入数据获得初步预测结果；调整特征提取方式和计算方法的组合方式优化集成模型，得到最终的预测结果。该方法提取基因序列中的多种信息特征，减少了计算时间，提高了预测特定细胞系增强子‑启动子相互作用的效果。