[发明专利]基于图神经网络的蛋白质结构模型质量评估方法在审
| 申请号： | 202210557804.6 | 申请日： | 2022-05-19 |
| 公开（公告）号： | CN114997366A | 公开（公告）日： | 2022-09-02 |
| 发明（设计）人： | 张沛东;沈红斌 | 申请（专利权）人： | 上海交通大学 |
| 主分类号： | G06N3/04 | 分类号： | G06N3/04;G06N3/08;G16B5/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 上海交达专利事务所 31201 | 代理人： | 王毓理;王锡麟 |
| 地址： | 200240 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 一种基于图神经网络的蛋白质结构模型质量评估方法，提取待预测类蛋白质诱饵里所有167种重原子在三维空间中的全局坐标作为输入，对其通过Rosetta软件的dual‑space relax预处理后，解析计算得到原始节点特征和边特征并输入基于注意力机制和图池化技术构建的图神经网络模型，使用预训练好的模型网络参数进行计算，分别得到反映该类蛋白质诱饵结构在蛋白质水平和氨基酸残基水平上与真实天然蛋白结构的差距的全局得分和局部得分。本发明能够更有鉴别力地关注那些本身精度已接近天然结构的类蛋白质诱饵结构，从而提升蛋白质结构模型评估在高精度数据集上的准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 神经网络 蛋白质 结构 模型 质量 评估 方法 | ||
【主权项】：
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