[发明专利]一种预测DNA序列对靶蛋白激活情况的方法在审

专利信息
申请号: 202210584310.7 申请日: 2022-05-26
公开(公告)号: CN115035953A 公开(公告)日: 2022-09-09
发明(设计)人: 赵丽娜;刘袁今生;尧浩东 申请(专利权)人: 中国科学院高能物理研究所
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B40/00
代理公司: 青岛智地领创专利代理有限公司 37252 代理人: 陈海滨
地址: 100049 北京*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种预测DNA序列对靶蛋白激活情况的方法,涉及生物序列分析及生物信息学技术领域,该方法包括:S1、基于现有的DNA序列数据集,对数据集中的每一条DNA序列进行特征向量的提取;S2、对S1中提取的特征向量进行分析,确保样本分布大致均匀,不存在某一类样本过多或过少的情况;S3、利用DNA序列的特征向量构建逻辑回归‑逐步回归模型;S4、训练S3中构建的逻辑回归‑逐步回归模型并进行评价。本发明使用的特征向量提取方法能够将复杂多样的DNA序列中蕴含的生物信息转换为简练的特征向量,对DNA序列分析中加入了逻辑回归与逐步回归相结合的模型,可以有效的剔除不显著的解释变量,在一般的机器学习模型的基础上提高了模型的准确率和敏感度。
搜索关键词: 一种 预测 dna 序列 蛋白 激活 情况 方法
【主权项】:
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