[发明专利]用于加速史密斯-沃特曼序列对齐的技术在审
申请号: | 202210792147.3 | 申请日: | 2022-07-05 |
公开(公告)号: | CN115905786A | 公开(公告)日: | 2023-04-04 |
发明(设计)人: | M·P·特尔里克;A·S·蒂鲁马拉;S·加德雷 | 申请(专利权)人: | 辉达公司 |
主分类号: | G06F17/16 | 分类号: | G06F17/16;G06F17/18;G06F9/50;G06F9/38 |
代理公司: | 北京市磐华律师事务所 11336 | 代理人: | 高伟 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 提供了用于加速史密斯‑沃特曼序列对齐的各种技术。例如,一组线程中的线程用于使用交错单元格布局将相关数据存储在寄存器中,同时为一个或更多个局部对齐问题计算子对齐数据。在另一个示例中,使用减少计算每个子对齐分数所需的周期数的专用指令。在另一个示例中,线程用于计算一个或更多个局部对齐问题的列的子集的子对齐数据,而其他线程基于从先前线程接收的部分结果数据开始计算子对齐数据。在计算出最大子对齐分数后,线程将最大子对齐分数和对应的位置存储在全局存储器中。 | ||
搜索关键词: | 用于 加速 史密斯 沃特曼 序列 对齐 技术 | ||
【主权项】:
暂无信息
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