[发明专利]去除细胞器基因组污染序列的染色体组装方法及装置在审
申请号: | 202210826141.3 | 申请日: | 2022-07-14 |
公开(公告)号: | CN115261378A | 公开(公告)日: | 2022-11-01 |
发明(设计)人: | 金花;宋威;刘少波;霍毅欣;鲁言明;朴威兰 | 申请(专利权)人: | 北京理工大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6869;G16B30/10;G16B30/20;G16B50/30 |
代理公司: | 北京鸿元知识产权代理有限公司 11327 | 代理人: | 温剑 |
地址: | 100081 *** | 国省代码: | 北京;11 |
权利要求书: | 暂无信息 | 说明书: | 暂无信息 |
摘要: | 本发明涉及一种去除细胞器基因组污染序列的染色体组装方法及装置,对样品进行二代测序、三代测序以及Hi‑C测序;对三代测序数据进行基因组组装;分别利用二代测序序列和三代测序序列对基因组进行纠错,并去除经纠错的基因组中的单倍体序列;利用细胞器数据库对基因组进行比对,鉴定并去除细胞器基因组序列;将Hi‑C测序序列比对到基因组;以及利用比对结果,将基因组最终组装成染色体,具体涉及基于本地构建的细胞器数据库,从基因组序列中鉴定并去除细胞器基因组序列,从而避免细胞器基因组被错误组装到染色体而导致染色体组装错误的去除细胞器基因组污染序列的染色体组装方法及装置。 | ||
搜索关键词: | 去除 细胞器 基因组 污染 序列 染色体 组装 方法 装置 | ||
【主权项】:
暂无信息
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