[发明专利]一种肠道菌群大数据的并行识别分析方法及系统有效
申请号: | 202210917101.X | 申请日: | 2022-08-01 |
公开(公告)号: | CN114999574B | 公开(公告)日: | 2022-12-27 |
发明(设计)人: | 衡益;王晨;万北宸;韩熠南 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G06K9/62;G16B40/00 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 刘俊 |
地址: | 510315 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及肠道菌群数据量化分析技术领域,提出一种肠道菌群大数据的并行识别分析方法及系统,其中包括以下步骤:获取肠道菌群样本的相对丰度数据并以子数据集进行数据划分,得到子数据集相应的菌群相对丰度矩阵;利用贝奥武夫集群并利用R语言的parallel包并行执行以下识别分析步骤:1)对所述菌群相对丰度矩阵进行预处理,去除所述菌群相对丰度矩阵中的缺失数据和空值数据;2)执行热聚类分析,输出热聚类图;3)执行相关性分析,输出相关性网络图;4)执行特殊菌类识别,输出特殊菌类识别结果;以及,根据经过预处理的菌群相对丰度矩阵执行菌群分布分析和多样性分析,生成肠道菌群相对丰度分布图和多样性分析图。 | ||
搜索关键词: | 一种 肠道 菌群大 数据 并行 识别 分析 方法 系统 | ||
【主权项】:
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