[发明专利]鉴定谱系树中分支点细胞命运决定的关键调控因子的方法在审

专利信息
申请号: 202211042461.6 申请日: 2022-08-29
公开(公告)号: CN115359840A 公开(公告)日: 2022-11-18
发明(设计)人: 徐云刚;郭茂祖;杨娟;邹权;郭琛;李如风;姚宇飞;李亚晨;李月森;邵锦瑞 申请(专利权)人: 西安交通大学
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10;G16B20/30
代理公司: 西安铭泽知识产权代理事务所(普通合伙) 61223 代理人: 崔瑞迎
地址: 710049 *** 国省代码: 陕西;61
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摘要: 发明属于生物技术领域,具体涉及一种鉴定谱系树中分支点细胞命运决定的关键调控因子的方法,包括:获取谱系树中所有细胞类型的高维数据;建立基于流形学习的计算模型REFIT,所述REFIT用于映射树形结构中多种细胞类型的高维数据到低维空间;将高通量测序数据数据输入REFIT模型,鉴别谱系树中分支点细胞命运决定的关键调控因子。本发明创新性地将细胞类型表示成可变剪接事件在多种表观修饰和RNA序列特征构成的高维空间中的点,然后借助于流形学习的降维作用,鉴定谱系树中分支点细胞命运决定的关键调控因子。
搜索关键词: 鉴定 谱系 中分 支点 细胞 命运 决定 关键 调控 因子 方法
【主权项】:
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