[发明专利]一种基于attention的双向表示模型的RNA修饰位点预测方法在审

专利信息
申请号: 202211259709.4 申请日: 2022-10-14
公开(公告)号: CN115424663A 公开(公告)日: 2022-12-02
发明(设计)人: 王鸿磊;刘辉;张林;张雪松;王栋;黄涛 申请(专利权)人: 徐州工业职业技术学院
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30;G06N3/08;G06N3/04;G06K9/62
代理公司: 西安铭泽知识产权代理事务所(普通合伙) 61223 代理人: 韩晓娟
地址: 221000 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种基于attention的双向表示模型的RNA修饰位点预测方法,其涉及生物信息学RNA转录后修饰位点预测领域。包括:将包含N1‑甲基腺苷修饰位点的RNA碱基序列为正样本和不包含N1‑甲基腺苷修饰位点的RNA碱基序列为负样本,进行词嵌入编码;将编码后的序列分为两路,在一个序列和另一个反转序列首段添加分类符号并进行位置编码;将编码后的两个序列输入编码模块中采用训练权重共享原则反复训练;将两路训练好的序列分类符号相加后经过全连接神经网络层和二分类器,预测哪个序列里包含N1‑甲基腺苷修饰位点。本发明能够描述复杂方面词的上下文关系,加强文本中重要词汇对情感分析的影响,从而准确预测RNA生物序列中是否包含N1‑甲基腺苷修饰位点。
搜索关键词: 一种 基于 attention 双向 表示 模型 rna 修饰 预测 方法
【主权项】:
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