[发明专利]一种基于并行和张量分块的AlphaFold推理高性能实现方法在审
| 申请号： | 202211302872.4 | 申请日： | 2022-10-24 |
| 公开（公告）号： | CN115719619A | 公开（公告）日： | 2023-02-28 |
| 发明（设计）人： | 程盛淦;路广阳;赵轩磊;马千里;方佳瑞;李升桂;卞正达;李永彬;柳泓鑫;麦思琪;刘育良;黄海晨;娄宇轩;吴俊铭;陈巍文 | 申请（专利权）人： | 北京潞晨科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B35/20 | 分类号： | G16B35/20;G16B30/10;G16B40/20;G06N3/045 |
| 代理公司： | 武汉菲翔知识产权代理有限公司 42284 | 代理人： | 吕小娜 |
| 地址： | 100080 北京市海淀*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于并行和张量分块的AlphaFold推理高性能实现方法，包括前处理部分和推理部分；所述前处理部分包括如下步骤：基于Ray的数据前处理并行策略；对于多条氨基酸序列的蛋白质复合物结构预测；所述推理部分包括如下步骤：优化的动态轴并行；自动张量分组；显存共享。本发明前处理部分：单条氨基酸序列的前处理速度为约原方法前处理速度的3倍；推理部分：能够更好地发挥GPU平台的性能，提高推理速度；可以有效地降低计算所需的显存，从而支持更长的输入氨基酸序列。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 并行 张量 分块 alphafold 推理 性能 实现 方法 | ||
【主权项】：
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