[发明专利]基于数值特征表达的基因组二四代融合组装方法及系统在审
申请号: | 202211336402.X | 申请日: | 2022-10-28 |
公开(公告)号: | CN115527612A | 公开(公告)日: | 2022-12-27 |
发明(设计)人: | 李国良;张也;陆嘉华;彭德华;陈建邦;江熠;陈星霖;唐善雯;张芷硕;吴蕾 | 申请(专利权)人: | 天津大学四川创新研究院 |
主分类号: | G16B30/20 | 分类号: | G16B30/20;G16B40/00;G16B20/20;G06K9/62 |
代理公司: | 成都金英专利代理事务所(普通合伙) 51218 | 代理人: | 郭肖凌 |
地址: | 610000 四川省成*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | 本发明公开了基于数值特征表达的基因组二四代融合组装方法及系统,该方法包括如下步骤:S1:读入测序文件,进行基因解析获得测序序列reads的自定义编号和碱基序列;S2:截取测序序列reads的碱基序列,获得质心特征值,并生成二代测序数据特征值矩阵和四代测序数据特征值矩阵;S3:按照设定误差阈值A搜索四代测序数据之间相似特征值对应的序列,将四代测序数据组装为基因序列骨架;S4:按照设定误差阈值B搜索二代测序数据和四代测序数据相似特征值对应的序列,将二代测序数据回帖至基因序列骨架;S5:输出最终组装结果和SNP信息表。本发明可提高涉及二四代组装和有参映射组装分析的生物信息学分析流程的速度。 | ||
搜索关键词: | 基于 数值 特征 表达 基因组 二四代 融合 组装 方法 系统 | ||
【主权项】:
暂无信息
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