[发明专利]单细胞RNA序列数据集的降维处理方法在审
| 申请号： | 202211350243.9 | 申请日： | 2022-10-31 |
| 公开（公告）号： | CN115512770A | 公开（公告）日： | 2022-12-23 |
| 发明（设计）人： | 彭德华;桂志鹏;吴华意 | 申请（专利权）人： | 武汉大学 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00 |
| 代理公司： | 武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42222 | 代理人： | 罗敏清 |
| 地址： | 430072 湖北省武*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种单细胞RNA序列数据集的降维处理方法，包括：搜索每个细胞的k个最邻近对象KNN，并通过KNN统计RNN；按照RNN的降序对细胞进行遍历，若该点被抽取，则剔除该细胞的KNN，直至所有细胞被遍历，输出采样得到的锚点细胞；构建所有锚点细胞的KNN图网络，计算所有锚点细胞两两之间的最短路径，并计算它们的高维概率分布；将所有锚点细胞降维至低维空间并不断其低维坐标，直到满足迭代条件终止迭代；对于每个未被采样的非锚点细胞，根据d+1个锚点细胞更新前与更新后的低维坐标之间的映射关系计算该非锚点细胞的低维空间坐标；将所有锚点细胞与非锚点细胞的低维坐标整合，输出其低维坐标。本发明大幅度提升了降维效率并降低了计算的复杂程度。 | ||
| 搜索关键词： | 单细胞 rna 序列 数据 处理 方法 | ||
【主权项】：
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