[发明专利]一种基于DRAM存内计算的碱基序列过滤方法与装置有效
| 申请号： | 202211354686.5 | 申请日： | 2022-11-01 |
| 公开（公告）号： | CN115409174B | 公开（公告）日： | 2023-03-31 |
| 发明（设计）人： | 杨弢;毛旷;汤昭荣;潘秋红;叶茂伟;黄智华;王京;王颖 | 申请（专利权）人： | 之江实验室 |
| 主分类号： | G06N3/123 | 分类号： | G06N3/123;G16B30/00 |
| 代理公司： | 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 | 代理人： | 孙孟辉 |
| 地址： | 311100 浙江省杭*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明公开一种基于DRAM存内计算的碱基序列过滤方法与装置，该方法为：步骤一，根据DRAM的存储阵列的列宽和所要筛选目标碱基序列的起点地址，筛选出目标碱基序列后进行重新整理组合；步骤二，对重新整理组合后的目标碱基序列分别进行碱基为A腺嘌呤、G鸟嘌呤、C胞嘧啶、T胸腺嘧啶的标记并获取到对应碱基的标记行；步骤三，对标记行数据进行移位后统计标记行中位置值为1的个数，获得对应碱基的统计结果；步骤四，利用参考碱基序列的统计结果与所述目标碱基序列的统计结果进行对比，过滤所筛选的目标碱基序列。本发明将位置匹配筛选放置在内存子阵列中进行，减少了大量数据在cpu与内存之间的搬移，成倍提升了计算效率，降低了功耗。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 dram 计算 碱基 序列 过滤 方法 装置 | ||
【主权项】：
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