[发明专利]基于三分支CNN的药物靶标结合亲和力预测方法在审
申请号: | 202211552644.2 | 申请日: | 2022-12-06 |
公开(公告)号: | CN116189795A | 公开(公告)日: | 2023-05-30 |
发明(设计)人: | 陆遥遥;吴宏杰 | 申请(专利权)人: | 苏州科技大学 |
主分类号: | G16C20/30 | 分类号: | G16C20/30;G16H70/40;G16B30/00;G16B25/00 |
代理公司: | 苏州科仁专利代理事务所(特殊普通合伙) 32301 | 代理人: | 郭杨 |
地址: | 215000*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 一种基于三分支CNN的药物靶标结合亲和力预测方法,包括采集DTA数据集,获取药物分子的SMILES序列和蛋白质氨基酸序列;采用RDKIT将所述SMILES序列预处理为具有顶点特征和邻接矩阵的图形;构建结合GAT‑GCN和MCNN的DTA预测模型,将所述SMILES序列、所述蛋白质氨基酸序列、所述图形输入所述DTA预测模型内输出预测结果;采用一致性指数和均方误差评估所述DTA预测模型。采用三分支CNN,分子的结构信息不会丢失,使用三个不同数量的卷积层和不同大小的卷积核,不仅能够获得较多的全局特征,局部特征也不会丢失,预测精确有效。 | ||
搜索关键词: | 基于 分支 cnn 药物 靶标 结合 亲和力 预测 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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