[发明专利]基于三分支CNN的药物靶标结合亲和力预测方法在审

专利信息
申请号: 202211552644.2 申请日: 2022-12-06
公开(公告)号: CN116189795A 公开(公告)日: 2023-05-30
发明(设计)人: 陆遥遥;吴宏杰 申请(专利权)人: 苏州科技大学
主分类号: G16C20/30 分类号: G16C20/30;G16H70/40;G16B30/00;G16B25/00
代理公司: 苏州科仁专利代理事务所(特殊普通合伙) 32301 代理人: 郭杨
地址: 215000*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 一种基于三分支CNN的药物靶标结合亲和力预测方法,包括采集DTA数据集,获取药物分子的SMILES序列和蛋白质氨基酸序列;采用RDKIT将所述SMILES序列预处理为具有顶点特征和邻接矩阵的图形;构建结合GAT‑GCN和MCNN的DTA预测模型,将所述SMILES序列、所述蛋白质氨基酸序列、所述图形输入所述DTA预测模型内输出预测结果;采用一致性指数和均方误差评估所述DTA预测模型。采用三分支CNN,分子的结构信息不会丢失,使用三个不同数量的卷积层和不同大小的卷积核,不仅能够获得较多的全局特征,局部特征也不会丢失,预测精确有效。
搜索关键词: 基于 分支 cnn 药物 靶标 结合 亲和力 预测 方法
【主权项】:
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