[发明专利]靶点选择方法及装置、计算机设备在审

专利信息
申请号: 202211553944.2 申请日: 2022-12-06
公开(公告)号: CN116189756A 公开(公告)日: 2023-05-30
发明(设计)人: 谢禹鑫;陈盛培;陈婉婷;潘小瑜 申请(专利权)人: 深圳市硬核酸生物科技有限公司
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B20/20
代理公司: 北京三高永信知识产权代理有限责任公司 11138 代理人: 徐立
地址: 518000 广东省深圳市南山区西丽街道*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 本公开提供了一种靶点选择方法及装置、计算机设备。方法包括:获取mRNA靶点序列和NGS数据;基于所述mRNA靶点序列生成n1×N的序列特征矩阵;将所述序列矩阵和所述序列特征矩阵进行矩阵叠加,得到(n1+1)×N的一级结构矩阵;将所述一级结构矩阵降维处理成1×N的矩阵,并对所述1×N的矩阵进行对角化,得到N×N的二级结构矩阵;基于最优路径搜索算法从所述二级结构矩阵中选取一个或多个最优路径,并基于所述最优路径确定所有候选靶标序列。该方案在选择靶点时不仅考虑了NGS实验的数据,还考虑了各个位点的特征,使得选出的位点结合率高。并且,该方法无需对每个位点进行生物实验,耗时短,成本低,效果好。
搜索关键词: 选择 方法 装置 计算机 设备
【主权项】:
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