[发明专利]一种Lb2Cas12a蛋白突变体活性预测的方法和系统在审

专利信息
申请号: 202211560928.6 申请日: 2022-12-07
公开(公告)号: CN116153403A 公开(公告)日: 2023-05-23
发明(设计)人: 殷雷;刘世奇;刘欢;周进 申请(专利权)人: 武汉大学
主分类号: G16B20/50 分类号: G16B20/50
代理公司: 武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42222 代理人: 江慧
地址: 430072 湖北省武*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明公开了一种Lb2Cas12a蛋白突变体活性预测的方法和系统,所述方法包括:获得Lb2Cas12a蛋白突变体的氨基酸序列以及相对应的酶活的原始数据;使用编号为KARS160105的AAindex索引来对氨基酸序列进行数字化编码,获得数字化的氨基酸序列;将所述数字化的氨基酸序列进行处理,获得由数字化的氨基酸序列的均值和突变的位置的数字组成的原始数据集,并随机分为训练集、验证集和测试集;利用训练集内的数据进行训练,获得初步的模型;利用验证集内的数据对初步的模型进行调整,获得最好的模型后在测试集上测试模型的泛化性;利用构建好的模型对所有Lb2Cas12a蛋白的单突变体进行逐条处理,获得Lb2Cas12a蛋白突变体活性的预测结果。该方法操作便捷。
搜索关键词: 一种 lb2cas12a 蛋白 突变体 活性 预测 方法 系统
【主权项】:
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