[发明专利]一种基于RNA测序的癌症溯源方法在审
申请号: | 202211567334.8 | 申请日: | 2022-12-07 |
公开(公告)号: | CN115798594A | 公开(公告)日: | 2023-03-14 |
发明(设计)人: | 方韩;俞容山 | 申请(专利权)人: | 厦门大学 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B30/00;G06F18/2415;G06N3/0464;G06N3/0455;G06N3/08 |
代理公司: | 厦门致群财富专利代理事务所(普通合伙) 35224 | 代理人: | 巫其荣 |
地址: | 361000 *** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于RNA测序的癌症溯源方法,包括以下步骤:S1、获取癌症数据中的TCGAFRESH数据、TCGAFFPE数据和TCGAMETASTATIC数据,并对癌症数据进行预处理;S2、基于transformer模型搭建癌症溯源网络模型;S3、采用预处理后的TCGAFRESH数据,对癌症溯源网络模型进行训练,得到训练后的癌症溯源网络模型;S4、将预处理后的TCGAFFPE数据和TCGA METASTATIC数据作为测试数据,将两个测试数据集分别送入训练后的癌症溯源网络模型中,对癌症进行分类溯源;本发明将transformer模型应用到了两万维RNA测序数据上,且可以使用所有的基因作为输入,不会存在基因筛选导致的丢失原始基因信息的问题,可有效提高癌症溯源分类的精确度。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 rna 癌症 溯源 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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