[发明专利]一种基于生物活性指纹的分子相似度计算方法及系统在审

专利信息
申请号: 202211683470.3 申请日: 2022-12-27
公开(公告)号: CN116013406A 公开(公告)日: 2023-04-25
发明(设计)人: 张继贤;郑双佳;陆威 申请(专利权)人: 星希尔生物科技(上海)有限公司
主分类号: G16B15/00 分类号: G16B15/00;G06N3/08;G06N3/0442
代理公司: 北京中南长风知识产权代理事务所(普通合伙) 11674 代理人: 穆丽红
地址: 200131 上海市浦东新区中国*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种基于生物活性指纹的分子相似度计算方法,包括:基于分子与靶点蛋白的生物活性数据对分子图进行预训练获得用于表征分子的图神经网络,基于图神经网络获得分子中每个原子的预训练向量化映射;将分子分解目标分子与查询分子,得到相应的子图;对子图的每一个节点中的所有原子的预训练向量化映射求和,作为该节点在对应子图中的表征si;遍历两个子图的最大公共子图可能性,并计算两个子图中查询分子和目标分子各个节点之间的谷本相似系数,最大公共子图谷本相似系数作为两个分子的相似度。还公开了对应系统及应用。为基于配体的药物发现带来极大的便利,降低相关工作人员对领域知识的依赖,提高药物设计和开发的效率,缩短研发周期。
搜索关键词: 一种 基于 生物 活性 指纹 分子 相似 计算方法 系统
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