[发明专利]一种基于向量相似性检索的蛋白质功能预测方法在审

专利信息
申请号: 202310069208.8 申请日: 2023-02-06
公开(公告)号: CN116092579A 公开(公告)日: 2023-05-09
发明(设计)人: 王辉;郭贵冰;原发杰 申请(专利权)人: 东北大学;西湖大学
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G16B40/00;G16B50/30;G06F18/22;G06F18/23;G06F18/214;G06F18/24;G06N3/048;G06N3/0499
代理公司: 沈阳东大知识产权代理有限公司 21109 代理人: 李珉
地址: 110819 辽宁*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要: 发明提供一种基于向量相似性检索的蛋白质功能预测方法,涉及深度学习和蛋白质功能预测技术领域。该方法首先获取蛋白质数据集并进行预处理后按比例划分为训练集、验证集和测试集;然后构建蛋白质功能预测网络模型,训练蛋白质的向量表征;并进行蛋白质功能预测网络模型的预训练;再通过向量相似性检索对测试集中的蛋白质进行功能预测;最后,针对下游蛋白质功能分类任务对蛋白质功能预测网络模型进行模型迁移,进而实现对不同类别的蛋白质功能分类。该方法提出的蛋白质功能预测网络模型可以有效的将相同功能蛋白质的语义表示在向量空间聚类在一起,使用向量相似性检索来做蛋白质功能分类任务,解决了Softmax函数做类别分类的弊端。
搜索关键词: 一种 基于 向量 相似性 检索 蛋白质 功能 预测 方法
【主权项】:
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