[发明专利]基于不平衡邻居约束随机游走的LncRNA-疾病关联预测方法在审
| 申请号： | 202310286302.9 | 申请日： | 2023-03-21 |
| 公开（公告）号： | CN116646012A | 公开（公告）日： | 2023-08-25 |
| 发明（设计）人： | 顾国生;刘世刚;谢国波;林志毅;谢伟洁;许浩杰 | 申请（专利权）人： | 广东工业大学 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;G16B20/00;G06F18/22;G06F17/11;G06F17/16 |
| 代理公司： | 广州中坚知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 44515 | 代理人： | 赖丽娟 |
| 地址： | 510000 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供一种基于不平衡邻居约束随机游走的LncRNA‑疾病关联预测方法(LNS‑NCURW)，包括以下步骤：S1：获取LncRNA‑疾病邻接矩阵A，融合LncRNA的表达相似性矩阵(LES)、功能相似性矩阵(LFS)和高斯相似性矩阵(LGS)得到LncRNA综合相似性矩阵(LS)，融合疾病的语义相似性矩阵(DSS)和高斯相似性矩阵(DGS)得到疾病综合相似性矩阵(DS)，并使用WKNKN算法来获取潜在的关联关系得到关联矩阵Y；S2：使用线性邻域相似性方法(LNS)重构LncRNA和疾病的相似性得到ILLS和ILDS，再分别计算LncRNA和疾病的邻居约束转移矩阵NCl和NCd；S3：整合lncRNA和疾病的相似性信息，通过矩阵乘法的结果更新关联矩阵Y，再利用邻居约束不平衡随机游走方法分别从LncRNA网络和疾病网络预测LncRNA‑疾病关联预测评分，然后再综合LncRNA网络方向评分和疾病方向评分得到最终预测得分P_SCORE。本发明引入了邻居约束来控制随机游走的游走方向，使得节点随机游走的时候往关联性更高的节点游走，使得关联性弱的节点得分低，而关联性高的节点得分高，从而提高预测的精准性，实现了lncRNA‑疾病的关联预测。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 不平衡 邻居 约束 随机 游走 lncrna 疾病 关联 预测 方法 | ||
【主权项】：
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