[发明专利]一种基于特征工程的基因编辑脱靶效应预测方法在审
| 申请号： | 202310402256.4 | 申请日： | 2023-04-14 |
| 公开（公告）号： | CN116364173A | 公开（公告）日： | 2023-06-30 |
| 发明（设计）人： | 黄一人;江振然 | 申请（专利权）人： | 华东师范大学 |
| 主分类号： | G16B15/30 | 分类号： | G16B15/30;G16B30/00;G16B40/20;G06F18/213;G06F18/241;G06N3/0442;G06N3/0464;G06N3/048;G06N3/08 |
| 代理公司： | 上海思真远达专利代理事务所(特殊普通合伙) 31481 | 代理人： | 李梅 |
| 地址： | 200241 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于特征工程的基因编辑脱靶效应预测方法，包括以下步骤：S1：获取公开数据集：获取包含sgRNA序列与目标DNA序列不匹配的公开实验数据作为可能的脱靶序列，所述数据集包括GUIDE‑Seq，HTGTS，BLESS；S2：每个序列样本长度为23个碱基，并以NGG结尾，对数据集标签进行预处理，将包含脱靶位点的样本标记为正样本，标签为1，不包含脱靶位点的样本标记为负样本，标签为0；S3：对样本数据集进行编码并加入特征。解决深度学习模型无法融合多样性特征以及数据集样本不平衡问题，提高CRISPR/Cas9脱靶预测精度和泛化能力，提升模型整体性能。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 特征 工程 基因 编辑 脱靶 效应 预测 方法 | ||
【主权项】：
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