[发明专利]一种基于自回归式模型的药物设计方法

摘要

一种基于自回归式模型的药物设计方法，将子词分词算法应用于生物学文本处理，对数据集中的蛋白质与配体信息进行训练，得到蛋白质和配体的分词器，并在此基础上构建自回归模型的分词器；处理并转化数据集中的原始数据为适用于自回归模型的文本形式，再通过所得分词器进行编码，构建自回归模型所需的训练数据集；利用训练数据集训练自回归模型，使其能理解配体的SMILES表示，并学习蛋白质与配体之间的相互作用模式；利用训练过的自回归模型生成预测的配体数据，并通过化学信息工具进行后处理，以获得具有具体化学结构的候选配体；对得到的候选配体进行评估和优化，利用化学或生物信息工具进行结构优化和活性预测，以确定有潜力成为有效药物的候选分子。