[发明专利]基于基因组突变特征及基因集表达特征的卵巢癌HRD分型系统及方法在审

专利信息
申请号: 202310741958.5 申请日: 2023-06-21
公开(公告)号: CN116741272A 公开(公告)日: 2023-09-12
发明(设计)人: 王育;陈光全;田秀;盛金丹;薛任浩;李珍 申请(专利权)人: 上海市第一妇婴保健院
主分类号: G16B20/50 分类号: G16B20/50;G16B20/20;G16B40/00;G16B30/10;G06N20/00
代理公司: 上海卓阳知识产权代理事务所(普通合伙) 31262 代理人: 金重庆
地址: 200040 *** 国省代码: 上海;31
权利要求书: 暂无信息 说明书: 暂无信息
摘要: 发明涉及一种基于基因组突变特征及基因集表达特征的卵巢癌HRD分型系统及方法。本发明的卵巢癌HRD分型系统包括全外显子测序(WES)数据预测模型、转录组测序(RNA‑seq)数据预测模型分析以及WES数据联合RNA‑seq数据预测模型,可通过输入肿瘤样本WES原始测序数据和/或RNA‑seq原始测序数据即可得到预测HRD状态的方法。本发明针对中国人群构建对照样本库,克服了对血液对照样本的依赖;克服了使用单一组学数据评估HRD状态的局限性,扩大了应用场景;克服使用单一数据类型来评估HRD状态的局限性;克服了之前判定HRD状态对BRCA1/2基因突变临床评级注释的依赖;针对中国人群优化分型系统参数;为判断卵巢癌患者的HRD状态,提供了更多的可选方法。
搜索关键词: 基于 基因组 突变 特征 基因 表达 卵巢癌 hrd 系统 方法
【主权项】:
暂无信息
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