[发明专利]一种肿瘤标志物的筛选系统和方法在审
申请号: | 202310744093.8 | 申请日: | 2023-06-21 |
公开(公告)号: | CN116837099A | 公开(公告)日: | 2023-10-03 |
发明(设计)人: | 蓝勋;王莉惠 | 申请(专利权)人: | 人科(北京)生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12Q1/6806;G01N33/574;G01N33/569;G16B20/50;G16B30/10;G16B25/20;G16B40/10;G06N20/00 |
代理公司: | 北京精金石知识产权代理有限公司 11470 | 代理人: | 张黎 |
地址: | 100085 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
权利要求书: | 暂无信息 | 说明书: | 暂无信息 |
摘要: | 本发明公开了一种基于cfDNA和ATAC‑seq的肿瘤标志物的筛选系统,涉及生物医学技术领域。所述的筛选系统包括肿瘤组织处理模块、染色质开放区间捕获模块、靶点筛选模块、靶点确认和验证模块,所述的靶点筛选模块包括:S1、使用软件将序列片段比对到参考基因组上;S2、将S1对比得到的结果进行过滤和排序;S3、找出ATAC数据的峰值分布;S4、将筛选得到的特异性峰值与健康人群体中特异性的峰值,进行差异峰值分析,筛选得到肿瘤特异性染色质开放区间;S5、分析得到在群体中共有的峰值,作为靶点。本发明的所需的细胞量较少,且信噪比更高。本发明将不同群体的染色质开放区间进行分开鉴定,提高了灵敏度。 | ||
搜索关键词: | 一种 肿瘤 标志 筛选 系统 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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