[发明专利]用于完成序列同源性检测的方法和装置有效

专利信息
申请号: 99802596.8 申请日: 1999-10-29
公开(公告)号: CN1110761C 公开(公告)日: 2003-06-04
发明(设计)人: 阿里斯·福劳拉特斯;艾塞德勒·若高瑟斯 申请(专利权)人: 国际商业机器公司
主分类号: G06F17/30 分类号: G06F17/30
代理公司: 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 代理人: 于静
地址: 美国*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 在本发明的序列同源性检测方面,一种基于计算机的检测一数据库中多个序列和一查询序列之间同源性的方法包含以下步骤。首先,该方法包括访问与该数据库关联的模式,每个模式代表该数据库中一个或多个序列的至少一部分,接下来,将该查询序列与这些模式比较,以检测是否该查询序列的一个或多个部分与这些模式代表的数据库序列中的一些部分有同源性。然后,对检测到的与该查询序列有同源性的每个序列产生一个评分,这里的序列评分是基于根据所检测到的序列每个同源部分产生的单个评分,而且该序列评分代表该查询序列与检测到的序列之间的同源性程度。
搜索关键词: 用于 完成 序列 同源性 检测 方法 装置
【主权项】:
1.一种基于计算机的检测数据库中多个序列和一个查询序列之间同源性的方法,该方法包含如下步骤:访问与该数据库关联的模式,每个模式代表数据库中一个或多个序列的至少一部分;比较查询序列和这些模式,以检测该查询序列的一个或多个部分是否与这些模式所代表的数据库序列的一些部分具有同源性;以及对检测到与该查询序列具有同源性的每个序列产生一个评分,这里的序列评分是基于根据检测到的序列的每个同源部分所产生的单个评分,而且该序列评分代表该查询序列和检测到的序列之间的同源性程度。
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